Куньинский район находится на юго-востоке Псковской области.Район граничит с Усвятским и Великолукским районами Псковской области,Торопецким и Западнодвинским Тверской, Велижским Смоленской области. На юго-востоке район выходит к Западной Двине.

На территории муниципального района образовано 9 муниципальных образований: одно городское поселение и 8 сельских поселения (волостей).

Центр района — поселок Кунья расположен в трехстах километрах от г. Пскова, тридцати пяти километрах от г. Великие Луки на берегу реки Лусня, впадающей в реку Кунья.